核酸以及核苷酸的基本换算
1．核酸的换算：
（1.1） 摩尔数与质量：
1 mg 1,000bp dna = 1.52 pmol
1 mg puc18/19 dna （2,688bp） = 0.57 pmol
1 mg pbr322 dna （4,361bp） = 0.35 pmol
1 mg sv40 dna （5,243bp） = 0.29 pmol
1 mg fx174 dna （5,386bp） = 0.28 pmol
1 mg m13mp18/19 dna （7.250bp） = 0.21 pmol
1 mg l phage dna （48,502bp） = 0.03 pmol
1 pmol 1,000bp dna = 0.66 mg
1 pmol puc18/19 dna （2,688bp） = 1.77 mg
1 pmol pbr322 dna （4,361bp） = 2.88 mg
1 pmol sv40 dna （5,243bp） = 3.46 mg
1 pmol fx174 dna （5,386bp） = 3.54 mg
1 pmol m13mp18/19 dna （7.250bp） = 4.78 mg
1 pmol l phage dna （48,502bp） = 32.01 mg
（1.2） 光吸收值与浓度：
1 od260 dsdna = 50 mg/ml = 0.15 mmol/l
1 od260 ssdna = 33 mg/ml = 0.10 mmol/l
1 od260 ssrna = 40 mg/ml = 0.12 mmol/l
1 mmol/l dsdna = 6.7 od260
1 mmol/l ssdna = 10.0 od260
1 mmol/l ssrna = 8.3 od260
（1.3） 分子量：
1个脱氧核糖核酸碱基的平均分子量为333 daltons
1个核糖核酸碱基的平均分子量为340 daltons
（1.4） 核酸末端浓度：
环状dna：
pmol ends = pmol dna ′ number of cuts ′ 2
线性dna：
pmol ends = pmol dna ′ （number of cuts ′ 2 + 2）
1 mg 1,000bp dna = 3.04 pmol ends
1 mg puc18/19 dna （2,688bp） = 1.14 pmol ends
1 mg pbr322 dna （4,361bp） = 0.7 pmol ends
1 mg sv40 dna （5,243bp） = 0.58 pmol ends
1 mg fx174 dna （5,386bp） = 0.56 pmol ends
1 mg m13mp18/19 dna （7.250bp） = 0.42 pmol ends
1 mg l phage dna （48,502bp） = 0.06 pmol ends
2．核苷酸的换算：
（2.1） 分子量：
mw （da） = 333 ′ n （number of bases）
（2.2） 浓度：
c （mmol/l or pmol/ml） = od260 / （0.01 ′ n）
c （ng/ml） = od260 ′ mw / （0.01 ′ n）
mw —— molecular weight
n —— number of bases
od260 —— absorbance at 260 nm
（2.3） 双链dna与寡核苷酸的熔点
短于25bp的双链寡核苷酸：
tm = 2 （a + t） + 4 （g + c）
长于25bp的双链寡核苷酸：
tm = 81.5 + 16.6 （ lg[j+] ） + 0.41 （%gc）
– （600/n） – 0.63 （%formamide）
n —— 引物的长度（以碱基数计算）
j+ —— 单价阳离子浓度
（2.4） dna与表达蛋白之间分子量换算
1 kb dna = 333 amino acid ≈ 3.7 ′ 104 da
10,000 da protein ≈ 270 bp dna
30,000 da protein ≈ 810 bp dna
50,000 da protein ≈ 2701 bp dna
100,000 da protein ≈ 27 kb dna
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1 mg 1,000bp dna = 1.52 pmol
1 mg puc18/19 dna （2,688bp） = 0.57 pmol
1 mg pbr322 dna （4,361bp） = 0.35 pmol
1 mg sv40 dna （5,243bp） = 0.29 pmol
1 mg fx174 dna （5,386bp） = 0.28 pmol
1 mg m13mp18/19 dna （7.250bp） = 0.21 pmol
1 mg l phage dna （48,502bp） = 0.03 pmol
1 pmol 1,000bp dna = 0.66 mg
1 pmol puc18/19 dna （2,688bp） = 1.77 mg
1 pmol pbr322 dna （4,361bp） = 2.88 mg
1 pmol sv40 dna （5,243bp） = 3.46 mg
1 pmol fx174 dna （5,386bp） = 3.54 mg
1 pmol m13mp18/19 dna （7.250bp） = 4.78 mg
1 pmol l phage dna （48,502bp） = 32.01 mg
（1.2） 光吸收值与浓度：
1 od260 dsdna = 50 mg/ml = 0.15 mmol/l
1 od260 ssdna = 33 mg/ml = 0.10 mmol/l
1 od260 ssrna = 40 mg/ml = 0.12 mmol/l
1 mmol/l dsdna = 6.7 od260
1 mmol/l ssdna = 10.0 od260
1 mmol/l ssrna = 8.3 od260
（1.3） 分子量：
1个脱氧核糖核酸碱基的平均分子量为333 daltons
1个核糖核酸碱基的平均分子量为340 daltons
（1.4） 核酸末端浓度：
环状dna：
pmol ends = pmol dna ′ number of cuts ′ 2
线性dna：
pmol ends = pmol dna ′ （number of cuts ′ 2 + 2）
1 mg 1,000bp dna = 3.04 pmol ends
1 mg puc18/19 dna （2,688bp） = 1.14 pmol ends
1 mg pbr322 dna （4,361bp） = 0.7 pmol ends
1 mg sv40 dna （5,243bp） = 0.58 pmol ends
1 mg fx174 dna （5,386bp） = 0.56 pmol ends
1 mg m13mp18/19 dna （7.250bp） = 0.42 pmol ends
1 mg l phage dna （48,502bp） = 0.06 pmol ends
2．核苷酸的换算：
（2.1） 分子量：
mw （da） = 333 ′ n （number of bases）
（2.2） 浓度：
c （mmol/l or pmol/ml） = od260 / （0.01 ′ n）
c （ng/ml） = od260 ′ mw / （0.01 ′ n）
mw —— molecular weight
n —— number of bases
od260 —— absorbance at 260 nm
（2.3） 双链dna与寡核苷酸的熔点
短于25bp的双链寡核苷酸：
tm = 2 （a + t） + 4 （g + c）
长于25bp的双链寡核苷酸：
tm = 81.5 + 16.6 （ lg[j+] ） + 0.41 （%gc）
– （600/n） – 0.63 （%formamide）
n —— 引物的长度（以碱基数计算）
j+ —— 单价阳离子浓度
（2.4） dna与表达蛋白之间分子量换算
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