直接插入式与其它分流式接口的优缺点
现在多数gc/ms联用仪器已经不需要使用这些复杂的连接器作接口(interface) 了。因为gc普遍使用毛细管色谱柱，流量大为降低，gc/ms联用多采取将色谱柱直接插入质谱的离子源的直接连接方式，接口仅仅是一段传输线(transfer line)，属于仪器的标准配置。如果所配的真空泵抽速有限，不能满足gc使用大孔径或填充柱大流量进样或其它特殊进样需要，也有用来分流的各种接口配件供选择，如毛细管限流器、喷嘴分离器及各种膜分离方式接口等。
直接插入式接口(传输线)结构非常简单，除了一根金属导管和加热套，以及温度控制和测温元件，无需其它流量设置等额外的部件。可加热的金属导管，在色谱柱出口和离子源入口之间，长度取决于色谱柱出口和离子源入口的距离，内径大小应能使不同柱径的色谱柱穿过，金属导管有一个带加热器的保温套，独立调节和控制所需要的温度，金属管的加热温度和色谱的使用温度应相匹配，以保持色谱柱流出物不发生冷凝。若只有保温套没有加热器的接口，结构上是不合理的。它不能独立加热和控温，因此传输线的温度是靠色谱柱箱和离子源温度的传导，不仅达不到较高的使用温度，还将导致传输线温度随着色谱柱箱和离子源温度变化而变化。
接插入式接口的优点:死体积小;无催化分解效应;无吸附;不存在与化合物的分子量、溶解度、蒸气压等有关的歧视效应;结构简单，只有一个连接件，减少了漏气的部位;色谱柱易安装，操作方便;与各种分流式接口比较大的好处是，样品几乎没有损失，可增加检测的灵敏度。
缺点:gc大载气流量受到真空泵抽速的限制，如果配置的真空泵抽速不够，不适用于大流量进样;其次，这种连接方式在更换色谱柱子时，系统必须放空，不能在抽真空状态下换柱子:再有，色谱柱固定液流失也随样品全部进入离子源，若色谱柱流失大，将会严重污染离子源，影响灵敏度;载气和样品同时进入离子源，虽然氦气质量小，容易被真空泵抽走，其电离电位(24.6ev)高于多数有机化合物(10ev左右)，但在70ev下仍然会被电离，对基线仍会有一定影响，激发态的中性粒子也会引起噪声，基线和噪声对灵敏度都有影响。
其它分流式接口优点是因分流而减少或限制了进入离子源的流量，允许使用口径较大的色谱柱和较大的载气流速，柱容量增大。缺点:明显地因分流而使样品损失掉一部分， 灵敏度受到影响;增加的分流部件，增加了可能漏气的部位;还涉及许多操作参数(分离、浓缩系数和收率)的优化。现在因真空泵抽速大，已不常使用分离式接
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