在定量pcr(也称rt-pcr或qpcr)中,荧光信号是由荧光探针或荧光dna结合染料(如sybr green)产生,其强度与pcr产物分子(扩增子)的数量成正比。每个循环结束时,收集荧光信号强度,通过将荧光强度与循环数作图,qpcr仪生成扩增曲线,其表示在整个pcr过程中产物的累积,通过这个过程,即可实现量化。如果样品中特定的序列(dna或rna)丰富,则在较早的循环中观察到扩增,ct值小;如果序列稀少,则在稍后的循环中观察到扩增,ct值大。此sop将涵盖总rna提取和两步法逆转录定量pcr(qrt pcr)的操作过程以及数据分析。
注意事项:
1、 所有步骤均应在超净工作台上进行,超净台紫外照射至少15min。
2、所有试剂应为此实验专用。
3、使用75%乙醇或其他去污剂擦拭工作台,避免表面污染。
4、 进入荧光定量pcr 操作实验室后需要佩戴一次性无菌口罩、无菌乳胶手套、实验中尽量避免与同事交谈,防止pcr 模板污染。
5、实验中使用各种规格的离心管,枪头及配制试剂和溶解沉淀用的水,均应焦碳酸二乙酯(depc)处理后使用,以去除吸附的rna酶污染。
6、 使用trizol试剂时,避免接触皮肤或衣服。避免吸入蒸气。
7、qpcr反应需要qpcr级水,试剂和试管。请务必使用正确类型的qpcr光学pcr管和盖子。不可用普通的pcr管。
8、加样前,先布局,规划加样顺序以避免交叉污染。
9、所有实验应均应设置无模板对照,其中包含除dna或cdna样品以外的所有反应组分。
10、先配制qpcr反应混合液,减少误差。
11、 加样后上机前,务必通过瞬离将反应液离至管底,并消除溶液中的气泡,因为气泡会干扰荧光检测且降低酶活性,从而降低扩增效率。
关键词:超净工作台 工作台 胶手套
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