Topoisomerase I 助力5min完成克隆

拓扑异构酶(topoisomerase) 是存在于细胞核内的一类酶,它们能够切断单链或双链dna的磷酸二酯键,然后重新缠绕和封口来更正dna连环数,从而控制dna的拓扑状态。dna拓扑异构酶分为两类,i型dna拓扑异构酶(dna topoisomerase i)和ii型dna拓扑异构酶(dna topoisomerase ii)。topoisomerase i是由美国科学家stewart shuman在1990年从牛痘病毒中发现的,同时具有限制性内切酶活性和连接酶活性,能够在dna复制过程中切断并重新连接dna。topoisomerase i可以在无需atp供能的情况下切断dna链,在切割单链dna后,会与末端dna片段形成暂时性中间体,并在释放压力后重新连接切口。由于topoisomerase i具有切断、连接dna的这种特性,常被用于克隆载体的构建(如topo克隆)以及ngs 建库中的接头连接等。
图1. topoisomerase i原理图[1]
topo克隆topo克隆是一种基于topoisomerase i的pcr产物快速克隆系统,利用topoisomerase i的连接原理,无需dna连接酶,可在5 min内高效连接dna片段。topoisomerase i识别并切割topo载体上的结合位点,切割完成后,与topo载体结合形成复合物。目的dna片段可在topoisomerase i的作用下与topo载体连接,形成克隆。技术路线
识别切割:topoisomerase i识别dna序列5’-(c/t)cctt-3’,并且能够在该位点对dna进行切割;
固定:topoisomerase i借助dna断裂的能量将酪氨酸残基与载体dna 3’末端形成共价键,从而固定在dna载体上;
连接:在加入目的dna片段(pcr product)后,目的dna片段的5'端羟基攻击载体片段的磷酸键,释放能量,使得目的dna片段的 5'端羟基与载体片段的3'端磷酸基团连接在一起;
脱落:topoisomerase i从载体分子上脱落。
图2.topo原理图
翌圣topoisomerase i翌圣topoisomerase i(cat#14971es)由翌圣镁孚泰生物zymeeditor酶进化平台经过重组表达获得,无外切酶残留、低宿主残留,可应用于ngs 建库中的接头连接、topo克隆等!
部分数据展示01
应用到topo克隆,克隆效果优于a品牌
使用不同批次的topoisomerase i进行topo克隆,分别连接2 kb的粘性末端、4 kb的平末端,实验结果表明,翌圣topoisomerase i运用到topo克隆中,克隆效果优于a品牌,阳性克隆率达100%(8/8)。
图3. topoisomerase i运用到topo克隆效果图
02外切酶残留
将50 u不同批次的topoisomerase i分别与相应的底物dna在37℃孵育4 h,琼脂糖凝胶电泳检测结果表明,翌圣topoisomerase i无外切酶残留。
图4. 外切酶残留检测
03e.coli基因组dna残留<1 copy/5u
对不同批次的topoisomerase i(cat#14971es)进行e.coli基因组dna残留检测,结果显示翌圣topoisomerase i宿主基因组dna残留远低于1 copy/5u。
图5. e.coli基因组dna残留检测
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产品名称
产品货号
产品规格
topoisomerase i
14971es
100 / 500 u

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