多重荧光免疫组化Q&A——第三弹

q:我该如何得到wan美的多色结果呢?
a:首先,您需要有质量不错的样本和抗体,这就已经是成功的一半(样本、抗体选择攻略),对于样本来说,脱片是我们需要预防的“头号公敌”,多色实验需要重复热修复洗脱抗体多次,假如片子脱片,轻则成像模糊,重则组织脱落前功尽弃,可以在开始实验之前先模拟几轮热修复,不加抗体和其他试剂,看看组织是否有脱落的迹象,如果脱落比较严重,则需要重新制备切片,如果有轻微脱片,则可以考虑购买抗体洗脱液(abs994),替代热修复的过程;然后,就可以开始做实验了,我们建议您先进行抗体和染料工作条件摸索,再上多染(参考下图流程),这样多染的成功率可以达到90%以上哦!(小爱经验之谈,即便是染了千百遍的常见指标,换个样本,染色效果就可能天差地别,有条件还是建议要做预实验)
最后的10%,就需要调整指标与染料搭配以及染色的顺序了。
q:有没有推荐的染料搭配和染色顺序呢?
a:染料搭配一般遵循“寡靶配强光,众靶配弱光”的原则,意思是表达比较弱的指标搭配荧光信号比较强的染料,表达相对强的指标搭配信号比较弱的染料,absin的tsa染料波长越短荧光强度越强,比如说需要染pd-1,cd8和cd3,我们手里有一个四色试剂盒(tsa520/tsa570/tsa650),通过ihc发现样本中pd-1的信号很少,cd3信号非常多,其次是cd8,于是选择tsa520搭配pd-1,tsa650搭配cd3,tsa570搭配cd8,比较合理。
接下来就是怎么安排染色先后顺序:①划分细胞定位,先外后内:确定每个指标的细胞定位,膜表达先染,胞浆或者胞核的后染(如果是指标比较多的情况下,胞内指标排在比较后面,经过前期多轮洗脱,可以不做细胞通透;如果指标很少,染胞内指标之前还是需要打孔,多个胞内指标也只需要打一次孔);②确定抗原修复方式,先酸后碱:碱修复比酸修复的力度会更强,个别抗体在用碱修复以后会染出来很多非特异性,所以如果是相同的细胞定位,就先染酸修复,再染碱修复的抗体;③根据ihc结果判别,先弱后强:组化结果显示指标比较少,比较弱的,排在前面染,理论上来说越靠前染的指标效果会越接近单标染色。
以上就是一些通用规则,但不同的指标还是可能出现变化,要想得到wan美的结果,就需要不同的排列组合一个一个尝试(如下表,“x”代表有信号),这样会比较耗费时间和试剂,您可以根据通用规则先行一次多染,然后各通道跟荧光单染做对比,如果效果差别很大,那就再调整染色顺序,如果单染的结果跟组化差别比较大(出现高背景,非特异性明显),就要考虑更换染料搭配。
q:我成像完了以后想要做数据分析,你们有什么软件推荐吗?
a:目前市面上数据分析软件还是比较多的,像免费的您可以下载imagej、qupath,缺点就是用法都需要您自行摸索;我们公司安装的是halo和strataquest两款软件,halo是付费的,strataquest是我们tg的扫描仪平台自带的,从功能、分析的精准度和可操作性来说,肯定是大大优于开源软件的,且有软件专业的技术支持团队能够答疑解惑。您可以根据您的实际情况选择合适的分析软件,如果您实在无从下手,也可以找absin,我们可以提供数据分析的服务~
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cd相关抗体:cd3、cd8a、cd4、cd68、cd206、cd163、cd20、cd19、cd45、cd56、cd10、cd117、cd138、cd14、cd146、cd15、cd1a、cd2、cd21、cd23、cd25、cd30、cd31、cd34、cd35、cd38、cd3g、cd44、cd5、cd7、cd79a、cd79b、cd99
角蛋白(ck)相关抗体:panck、ck-4、ck hmw、ck-1、ck-10、ck-14、ck-17、ck-18、ck-19、ck-20、ck-5、ck-5&6、ck-6、ck-7、ck-8、ck-8&18
癌症肿瘤相关:p120、p16、p21、p40、p53、p63、afp、alk、amacr、anxa1、aurora-b、bcl-6、ctnnb1、ca125、cdk4、cdx2、cea、ccnd1、c-met、c-myc、dog1、cdh1、egfr、epcam、erg、ezh2、fabp3、fgfr2、foxp1、gata-3、gcdfp-15、gpc3、gzmb、her-2、idh1 r132h、ki-67、ldlr、mcm7、mcm3、mgmt、msh2、msh6、muc1、muc2、muc4、mum1、myod1、myogenin、myosin (smooth muscle)、napsin-a、n-cadherin、olig2、pax-2、pax-5、pax-8、pct、pd-1、phh3、plap、pmel-17、pdpn、pr、psa、psap、s100a1、s100p、sall4、satb1、sf-1、sox10、sox11、sox2、stat6、stathmin、tcl1、tfe3、tg、tle1、top2a、tpo、trps1、ttf-1、type i cytokeratins、type ii cytokeratins、uroplakin iii、villin、wt1、zap-70
神经相关:atrx、p75 ngf receptor、cga、ddx4、gfap、λlight chains、mbp、neun、neurofilament、nse、olig2、p75 ngf receptor、s100、syp
血管:ace2、vegf、vwf
钙蛋白:calb1、caldesmon、calponin、calcitonin、calprotectin
其他:mpo、ar、arg-1、ar-v7、b2m、cldn1、collagen type ⅳ、col4a5、erα、gh、hbsag、hcg、hcg-beta、hpl、igd、igg、igm、igfbp3、insulin、oct3/4、scgn、somatostatin、tdt、actin、desmin
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