1.选用优质的琼脂糖:不同品牌的琼脂糖在质量上有较大的差异。劣质琼脂糖会导致dna条带模糊,甚至条带缺失。因此请尽量选择质量稳定可靠的品牌。
2.选择适当的凝胶浓度:
琼脂糖凝胶的线性dna分辨范围
3.凝胶制备:配制凝胶和电泳应选用相同的1x缓冲液;使用的容器体积至少是凝胶溶液的3倍,以免溶液沸腾时溢出;制胶过程中尽量赶除气泡;根据样品的浓度和体积选择适当大小的梳子。
4.选择适当的电泳缓冲液:genstar® sd缓冲液(cat. no. e101-50)和tbe缓冲液适用于分离比较小的dna片段,tae缓冲液(cat. no. e102-50)适用于分离比较大的dna片段;缓冲液应及时更新;胶回收纯化应使用新鲜配制的1x电泳缓冲液,以防核酸酶和dna杂带污染。
5.核酸样品的准备:提取的dna样品应去除蛋白和多余的盐分等杂质;pcr样品应尽量在24小时内电泳检测,否则条带容易模糊。
6.上样缓冲液:所有泳道应使用相同的上样缓冲液,以防止因离子强度不同造成条带迁移率偏差。
7.适量上样:上样过多会导致上样孔超载,出现拖带现象;上样体积过小可能导致条带亮度不均。
8.电压及电泳时间:根据电泳槽型号、凝胶浓度、电泳缓冲液种类和目的条带大小等选择适当的电压和电泳时间。使用genstar®sd电泳缓冲液时,电压设置为20~35 v/cm胶长;使用tae或tbe缓冲液时,最大电压以不超过20 v/cm胶长为宜。
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